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腰椎退行性滑移中椎间盘和椎旁肌变化的mri和x线定量分析
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腰椎退行性滑移中椎间盘和椎旁肌变化的mri和x线定量分析
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【原创】imagej使用达人指南，分享给大家！
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分享一下那个细胞运动轨迹怎么使用
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Annsel 分享一下那个细胞运动轨迹怎么使用ImageJ学习-图像处理
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楼主，设置threshold的时候遇到好多杂质怎么解决啊？
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分析小胶质细胞的形态，原图是Iba1的DAB显色。小胶质细胞有三种形态：A、B是ramifiedC、D是hypertrophiedE、F是bushy cells小胶质的胞体逐渐变大，突起变粗，二级突起减少，细胞朝着阿米巴状发展。
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血管计算血管的数量的意义倒不是很大，因为血管有横截面以及与切片平行的血管，不根据管径的大小来单纯计算数量意义不大。如果都是横截面的血管可以根据周长来统计不同管径管的血管分别有多少。至于与切片平行的血管就有点难办了，可能被切到的程度都不一样。有一种软件可以根据管径的大小来识别同一管径的血管。比如输入管径是6.5μm的血管，进行分析，得到如下结果：
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测量叶片面积
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楼主，求问我打开Zeiss共聚焦的czi文件，为什么通道颜色都变成灰色了呢？怎么才能保持原来的颜色呢？
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marinagyy11 楼主，求问我打开Zeiss共聚焦的czi文件，为什么通道颜色都变成灰色了呢？怎么才能保持原来的颜色呢？GRB彩色模式才显示彩色，你看一下图像模式，你也可以把图片发给我看看
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曾北 marinagyy11 楼主，求问我打开Zeiss共聚焦的czi文件，为什么通道颜色都变成灰色了呢？怎么才能保持原来的颜色呢？GRB彩色模式才显示彩色，你看一下图像模式，你也可以把图片发给我看看文件没法上传，只能弄的百度云链接，万分感谢?链接: /s/1hrVKPXq 密码: m2kv
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marinagyy11 曾北 marinagyy11 楼主，求问我打开Zeiss共聚焦的czi文件，为什么通道颜色都变成灰色了呢？怎么才能保持原来的颜色呢？GRB彩色模式才显示彩色，你看一下图像模式，你也可以把图片发给我看看文件没法上传，只能弄的百度云链接，万分感谢?链接: /s/1hrVKPXq 密码: m2kv你的图片本来保存的8-bit的灰度图片，所以打开是灰度图片。不过我们可以给四个不同的同道加不同的伪彩：
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我试了用LUT改颜色只能改一张，怎么能够一个sequence一起改呢？
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marinagyy11 我试了用LUT改颜色只能改一张，怎么能够一个sequence一起改呢？私信我，或者加帖子题目讨论组讨论更好，网页版我未必在
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marinagyy11 我试了用LUT改颜色只能改一张，怎么能够一个sequence一起改呢？见附件
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曾北 marinagyy11 我试了用LUT改颜色只能改一张，怎么能够一个sequence一起改呢？见附件清楚明白，感谢楼主?
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曾北 marinagyy11 我试了用LUT改颜色只能改一张，怎么能够一个sequence一起改呢？见附件666
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在进行荧光平均光密度的计算时，发现如果选择8bit,16bit,32bit的都能出来荧光数值，但是却发现IntDen RawIntDen 这两个数值大小一样，也不知道原因出在哪里？明天就要开组会了，可是这个数据一直没处理好
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君君臣臣子子 在进行荧光平均光密度的计算时，发现如果选择8bit,16bit,32bit的都能出来荧光数值，但是却发现IntDen RawIntDen 这两个数值大小一样，也不知道原因出在哪里？明天就要开组会了，可是这个数据一直没处理好
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你怎么对这个软件这么熟悉，挺佩服上面的图的，同时这个是我加入丁香后，第一个有人回复的帖子，必须点个赞。是的，这样之后出来了大致趋势，但是有个问题就是，里面的set threshold levels 的upper threshold level 一般会自动弹出一个数值，如果是多组实验的话，这个数值一定要保持一致吗？如果不是的话，那么人为的因素就太大了，我不知道为什么上传不了图片，只能将问题打出来了
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君君臣臣子子 你怎么对这个软件这么熟悉，挺佩服上面的图的，同时这个是我加入丁香后，第一个有人回复的帖子，必须点个赞。是的，这样之后出来了大致趋势，但是有个问题就是，里面的set threshold levels 的upper threshold level 一般会自动弹出一个数值，如果是多组实验的话，这个数值一定要保持一致吗？如果不是的话，那么人为的因素就太大了，我不知道为什么上传不了图片，只能将问题打出来了理论上是要保证我们的分析条件一致，更有可比性。但是实际情况是，免疫组化化学通常用来分析平均光密度值，免疫荧光图片不适合分析平均光密度值。这一点涉及图片的拍摄问题，免疫组化的图片，同一个倍数下我们需要保证光源的条件～亮度～滤光片～曝光……一模一样，同时做到手动的背景校正。这样就会有通常文献里面说的着色深浅的区别，因为有许多组化的测量也许不是分布数量的差异，而是面积一样着色深浅的区别，也就是面积一样大，着色深的含量多！那么问题来了，本身组化的图片就有着色深浅，那么我们还能用一样的分析组织用以选定所有的阳性细胞和区域吗？显然不能。所以我们保证拍摄条件一致的前提下，分析时保证选定所有的阳性区域，这就是我们的标准，就是统一。对于荧光图片，拍摄条件一般都不一样，比较平均光密度值的大前提其实不存在。
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终于可以上传图片了，对于荧光图片，老师一直强调要在同样观察倍数，滤镜和曝光时间下拍，荧光的话，有一个猝灭的问题，涉及一个开始的激发的时长的问题，但是如果这些都保证一样的话，如上图的话，是一个测ROS的图，这两张图明显看到了平均荧光密度不一样，这样算出来的平均荧光密度也不准确吗?如果是这样的话，那么用什么来衡量适合点呢？
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东月来星 够专业这个是看的你的帖子～在此表示感谢～本人并没有做过血管形成实验，想来也不是很难。但是要得到非常清晰现象明显便于分析的图片，应该还是需要一些经验和技巧。以后有需要再向你请教！
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我所发的有关imagej软件帖子汇总1 Imagej软件进行Sholl analysis 2 imagej统计气泡的粒径
3 imagej软件
4 imagej软件测量鼠脑切片的梗塞区域面积
5 imagej软件分析划痕实验（计算划痕面积及伤口愈合百分比）
6 关于荧光共定位分析
7 Imagej分析leaf的相关参数
8 使用imagej测量大血管截面
9 imagej边缘提取
10 Imagej分析血管
11 【原创】imagej基本操作
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Helmholtz AnalysisInstallation:
to the Plugins folder and restart ImageJ.
ImageJ plugin to estimate the wavelength distribution of an image with periodic features, as well as the orientation of the structures. The 2D Helmholtz equation is applied to estimate the wavenumber, k = 2*pi/lambda. Developed as a Custom ImageJ Plugin for Bill Mohler for application to images of muscle tissue. The original name of the plugin was Muscle Tone
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BoneJ is a plugin for bone image analysis in . It provides free, open source tools for trabecular geometry and whole bone shape analysis.
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像这种好帖必须收藏啊
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140个分形维数
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有两个问题想请教楼主，ImageJ可以测量三维图像中某个点的空间坐标吗？另外，测出了坐标后，可以计算各个点坐标之间的函数关系吗？
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zrxdxy 有两个问题想请教楼主，ImageJ可以测量三维图像中某个点的空间坐标吗？另外，测出了坐标后，可以计算各个点坐标之间的函数关系吗？
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测量细胞壁厚度面积/长度=厚度
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关于丁香园这里是&&h阿雨&&的丁香客，立即开通并关注，最新动态不容错过！
发帖：0&&&&收藏：1
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第一次提问，请给新人点指导啊，拜托前辈们了
&发布了新帖&
如题，本人预测以上三项指标，但苦于遇到以下问题不得进行:1、单位，不同公司给的试剂盒检测范围不同且单位不同，其中肌酸激酶的U/L和ng/L该如何转换？2、范围，不知道各位有知道一般小鼠的基础值范围是多少吗？查了一些文献但说法不一，有的相差甚远，不知道是不是检测方法导致的不？
&回复了帖子&
非常感谢您！洗耳恭听！！
&回复了帖子&
请问楼主，你知道怎么计算了吗？？能否相传之？
&回复了帖子&
前辈，你好！和你一样，我做的小鼠肌肉石蜡切片，也是出现很多一道道的白色缝隙，有几个问题想请教：1、固定液我用的Bouin（实验室师姐之前用过的我就没多想，直接用这种固定液的），固定时间大于两周，会不会有影响？2、你的切片是多厚的，我切的4um，是薄还是厚？
&回复了帖子&
前辈，你好！请问这篇文献你有找到吗？想向你求助，我是新人，另外想问你跑台运动对大鼠和小鼠的一般训练强度差异是怎样的，你有做过相关的吗？谢谢，期待你的回复！
&回复了帖子&}