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&2008- Inc. All Rights Reserved 豆丁网文献管理工具Bibus使用简介
1.什么是Bibus？
All about Bibus
Bibus is a bibliographic database. It uses a MySQL or SQLite database to store references. It can directly insert references in OpenOffice.org and MS Word and generate the bibliographic index.
认识一下Bibus
Bibus是一款免费的文献管理工具，用Python写的。使用MySQL或SQLite（任选其一）数据库储存参考文献数据。它能在OpenOffice及MS Word中直接插入引文，而无需在Word中安装宏，或插件什么的。并自动生成参考文献目录。其功能目前已与商业软件Endnote，RM接近，支持Unicode，支持中文。
支持的操作系统（跨平台）： 32-bit MS Windows (95/98), 32-bit MS Windows (NT/2000/XP), All 32-bit MS Windows (95/98/NT/2000/XP), All POSIX (Linux/BSD/UNIX-like OSes), Linux, Win2K, WinXP
2.Bibus在Windows下的界面
3.Bibus使用的简要说明（主要是XP系统，MS－Word环境）
3.1程序参数设置（Edit｜Preference）
安装完程序之后，第一步要做的事即是这个。它用于个人习惯的设置。这里包括：Display，Printing，Search，Duplicates，Editor，Shortcuts，Paths，Database，Word Processor。这里仅就几个常用的作简单的介绍。Display中主要设置主窗口中参考文献的显示方式，如上图的Athor_Title_Year_Abstract等，常用的还有Bibilographic Type（文献类型，如Article，Book，Magazine等）。此外还可以设置它们显示的顺序及默认文献排序规则，程序缺省是根据Idenfifer字段排序。Duplicates中主要是设置你要如何识别相同的文献以删除重复的文献。Database中主要设置使用哪种数据库格式存储参考文献，一般用户应选择SQLite，它是独立的，不需要其它额外的设置。还有就是MySQL了，一般用户不选。Word Processor是设置你将在哪种文字处理软件中插入参考文献，如我现在用MS-Word就选MS-Word了，如果你装了OpenOffice，则还可选择OpenOffice。
由于当前版本存在的问题（中文引文插入的问题），本部分的内容将在下一个修正版发布后继续完善……
4.中文Style下载
自己编的中文通用参考文献style，& 使用方法：Styles｜Load 即可
效果参考：
参考效果：假如我们是对的[1]那么我们为什么不坚持呢[2]，又假如我们是错的……
参考文献[1] Braun RL,Burnham AK. Analysis Of Chemical Reaction Kinetics Using A Distribution Of Activation Energies And Simpler Models. Energy & Fuels[J],):153-161.[2] Imbus SW, Katz BJ,Urwongse T. Predicting Co2 Occurrence On A Regional Scale: Southeast Asia Example. Organic Geochemistry[J],-3):325-345.
5.相关工具
SQLite Databases Browser 可以查看用Bibus创建的文献数据库。利用该软件你可以轻松增加，删除，编辑某一条文献。下载地址：
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sqlite源码剖析
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3秒自动关闭窗口上一篇：写在前面:谢谢各位的关注,没想到会有这么多人关注。高兴的同时，也感到压力，因为我接触SQLite也就几天，也没在实际开发中用过，只是最近项目的需求才来研究它，所以我很担心自己的文章是否会有错误，误导别人。但是我很想把自己的学习成果与大家分享，所以如果大家觉得我有不对的地方，望不吝赐教。我原打算直接从VDBE入手的，因为它起着承上启下的作用，是整个SQLite的核心，并分析源码，但考虑到这是一个系列的文章，我希望能把问题说全，所以还是从基本概念入手，对于初学者，如果没有这些概念，是很继续下去的。好了，下面开始第二章，由于这一章内容很多，我将分两部分讨论，下面开始第一部分。 1、 API由两部分组成: 核心API(core API) 和扩展API（extension API）核心API的函数实现基本的数据库操作：连接数据库，处理SQL，遍历结果集。它也包括一些实用函数，比如字符串转换，操作控制，调试和错误处理。扩展API通过创建你自定义的SQL函数去扩展SQLite。1.1、SQLite Version 3的一些新特点：(1)SQLite的API全部重新设计，由第二版的15个函数增加到88个函数。这些函数包括支持UTF-8和UTF-16编码的功能函数。(2)改进并发性能。加锁子系统引进一种锁升级模型(lock escalation model)，解决了第二版的写进程饿死的问题(该问题是任何一个DBMS必须面对的问题)。这种模型保证写进程按照先来先服务的算法得到排斥锁(Exclusive Lock)。甚至，写进程通过把结果写入临时缓冲区(Temporary Buffer)，可以在得到排斥锁之前就能开始工作。这对于写要求较高的应用，性能可提高400%（引自参考文献）。(3)改进的B-树。对于表采用B+树，大大提高查询效率。(4)SQLite 3最重要的改变是它的存储模型。由第二版只支持文本模型，扩展到支持5种本地数据类型。总之，SQLite Version 3与SQLite Vertion 2有很大的不同，在灵活性，特点和性能方面有很大的改进。1.2、主要的数据结构(The Principal Data Structures)SQLite由很多部分组成－parser,tokenize,virtual machine等等。但是从程序员的角度，最需要知道的是:connection, statements, B-tree和pager。它们之间的关系如下： 600) this.width = 600;attachimg(this, 'load');" onmouseover="attachimginfo(this, 'attach_13910', 1);attachimg(this, 'mouseover')" onclick="zoom(this);" onmouseout="attachimginfo(this, 'attach_13910', 0, event)" style="CURSOR:"
/>() 9:52:22上图告诉我们在编程需要知道的三个主要方面：API,事务(Transaction)和锁(Locks)。从技术上来说，B-tree和pager不是API的一部分。但是它们却在事务和锁上起着关键作用（稍后将讨论）。1.3、Connections和StatementsConnection和statement是执行SQL命令涉及的两个主要数据结构，几乎所有通过API进行的操作都要用到它们。一个连接(Connection)代表在一个独立的事务环境下的一个连接A (connection represents a single connection to a database as well as a single transaction context)。每一个statement都和一个connection关联，它通常表示一个编译过的SQL语句，在内部，它以VDBE字节码表示。Statement包括执行一个命令所需要一切，包括保存VDBE程序执行状态所需的资源，指向硬盘记录的B-树游标，以及参数等等。1.4、B-tree和pager一个connection可以有多个database对象---一个主要的数据库以及附加的数据库，每一个数据库对象有一个B-tree对象，一个B-tree有一个pager对象(这里的对象不是面向对象的“对象”，只是为了说清楚问题)。Statement最终都是通过connection的B-tree和pager从数据库读或者写数据，通过B-tree的游标(cursor)遍历存储在页面(page)中的记录。游标在访问页面之前要把数所从disk加载到内存，而这就是pager的任务。任何时候，如果B-tree需要页面，它都会请求pager从disk读取数据，然后把页面(page)加载到页面缓冲区(page cache)，之后，B-tree和与之关联的游标就可以访问位于page中的记录了。如果cursor改变了page，为了防止事务回滚，pager必须采取特殊的方式保存原来的page。总的来说，pager负责读写数据库，管理内存缓存和页面（page），以及管理事务，锁和崩溃恢复(这些在事务一节会详细介绍)。总之，关于connection和transaction，你必须知道两件事：(1) 对数据库的任何操作，一个连接存在于一个事务下。(2) 一个连接决不会同时存在多个事务下。whenever a connection does anything with a database, it always operates under exactly one transaction, no more, no less.1.5、核心API核心API 主要与执行SQL命令有关，本质上有两种方法执行SQL语句：prepared query 和wrapped query。Prepared query由三个阶段构成：preparation，execution和finalization。其实wrapped query只是对prepared query的三个过程包装而已，最终也会转化为prepared query的执行。1.5.1、连接的生命周期(The Connection Lifecycle)和大多数据库连接相同，由三个过程构成：（1） 连接数据库(Connect to the database)：每一个SQLite数据库都存储在单独的操作系统文件中，连接，打开数据库的C API为：sqlite3_open()，它的实现位于main.c文件中，如下：int sqlite3_open(const char *zFilename, sqlite3 **ppDb)
& return openDatabase(zFilename, ppDb, SQLITE_OPEN_READWRITE | SQLITE_OPEN_CREATE, 0);
复制代码当连接一个在磁盘上的数据库，如果数据库文件存在，SQLite打开一个文件；如果不存在，SQLite会假定你想创建一个新的数据库。在这种情况下，SQLite不会立即在磁盘上创建一个文件，只有当你向数据库写入数据时才会创建文件，比如：创建表、视图或者其它数据库对象。如果你打开一个数据，不做任何事，然后关闭它，SQLite会创建一个文件，只是一个空文件而已。另外一个不立即创建一个新文件的原因是，一些数据库的参数，比如：编码，页面大小等，只在在数据库创建前设置。默认情况下，页面大小为1024字节，但是你可以选择512-32768字节之间为 2幂数的数字。有些时候，较大的页面能更有效的处理大量的数据。（2） 执行事务(Perform transactions)：all commands are executed within transactions。默认情况下，事务自动提交，也就是每一个SQL语句都在一个独立的事务下运行。当然也可以通过使用BEGIN..COMMIT手动提交事务。（3） 断开连接(Disconnect from the database)：主要是关闭数据库的文件。1.5.2、执行Prepared Query前面提到，预处理查询(Prepared Query)是SQLite执行所有SQL命令的方式，包括以下三个过程：(1) Prepared Query：分析器（parser），分词器(tokenizer)和代码生成器(code generator)把SQL Statement编译成VDBE字节码，编译器会创建一个statement句柄(sqlite3_stmt)，它包括字节码以及其它执行命令和遍历结果集的所有资源。相应的C API为sqlite3_prepare()，位于prepare.c文件中，如下：int sqlite3_prepare(
& sqlite3 *db,& & & & & & & /* Database handle. */
& const char *zSql,& & & &
/* UTF-8 encoded SQL statement. */
& int nBytes,& & & & & & &
/* Length of zSql in bytes. */
& sqlite3_stmt **ppStmt,& & /* OUT: A pointer to the prepared statement */
& const char **pzTail& & &
/* OUT: End of parsed string */
& rc = sqlite3LockAndPrepare(db,zSql,nBytes,0,ppStmt,pzTail);
& assert( rc==SQLITE_OK || ppStmt==0 || *ppStmt==0 );& /* VERIFY: F13021 */
复制代码(2) Execution：虚拟机执行字节码，执行过程是一个步进(stepwise)的过程，每一步(step)由sqlite3_step()启动，并由VDBE执行一段字节码。由sqlite3_prepare编译字节代码，并由sqlite3_step()启动虚拟机执行。在遍历结果集的过程中，它返回SQLITE_ROW，当到达结果末尾时，返回SQLITE_DONE。(3) Finalization：VDBE关闭statement，释放资源。相应的C API为sqlite3_finalize()。通过下图可以更容易理解该过程： 600) this.width = 600;attachimg(this, 'load');" onmouseover="attachimginfo(this, 'attach_13911', 1);attachimg(this, 'mouseover')" onclick="zoom(this);" onmouseout="attachimginfo(this, 'attach_13911', 0, event)" style="CURSOR:"
/>() 9:52:22最后以一个具体的例子结束本节，下节讨论事务。#include &stdio.h&
#include &stdlib.h&
#include &sqlite3.h&
#include &string.h&
int main(int argc, char **argv)
& & int rc, i,
& & sqlite3 *
& & sqlite3_stmt *
& & char *
& & const char *
& & //打开数据
& & rc = sqlite3_open(&foods.db&, &db);
& & if(rc) {
& & & & fprintf(stderr, &Can't open database: %s\n&, sqlite3_errmsg(db));
& & & & sqlite3_close(db);
& & & & exit(1);
& & sql = &select * from episodes&;
& & //预处理
& & rc = sqlite3_prepare(db, sql, (int)strlen(sql), &stmt, &tail);
& & if(rc != SQLITE_OK) {
& & & & fprintf(stderr, &SQL error: %s\n&, sqlite3_errmsg(db));
& & rc = sqlite3_step(stmt);
& & ncols = sqlite3_column_count(stmt);
& & while(rc == SQLITE_ROW) {
& & & & for(i=0; i & i++) {
& & & & & & fprintf(stderr, &'%s' &, sqlite3_column_text(stmt, i));
& & & & fprintf(stderr, &\n&);
& & & & rc = sqlite3_step(stmt);
& & //释放statement
& & sqlite3_finalize(stmt);
& & //关闭数据库
& & sqlite3_close(db);
& & return 0;& &
复制代码（文/）下一篇：源码下载：
附件: 亲，您没有权限下载或查看附件喔:-)
试试 或 吧！
kyeewqweqwe
回复 1# cobra 的帖子
谢谢分享 ,分析得很深入
good!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
谢谢楼主啊
3x for share
谢谢分享好书了
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